Das Dorf Zeiningen liegt am Möhlinbach im Fricktal, an der Stelle, wo das schmale Möhlintal in die weite Lössebene des Rheins austritt. Im Nordosten besitzt Zeiningen einen grossen Anteil am Möhliner Feld. Die Gemeinde gehört zum Bezirk Rheinfelden im Fricktal an der Grenze zum Kanton Basel-Landschaft.
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Ortsteile: Ort Wallbach, Ort Zeiningen, Ort Höhenhof, Ort Rötihof, Ort Raihof, Ort Tschopperthof, Ort Birkenhof, Ort Widmatthof, Ort Lindenhof, Ort Landhof, Ort Egelseehof, Ort Eichhof, Ort Auhof
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